Ich konzentriere mich erstmal auf den Bereich Rollenspiele. Da haben wir zum einen natürlich die üblichen Verdächtigen (Final Fantasy) wobei speziell
der sechste (bzw. dritte in der US Version) heraussticht. Spielerisch fast noch besser ist Chrono Trigger, welches vor allem von seinen Charakteren und den kleinen Geschichten um sie herum lebt.
Secret of Mana und Secret of Evermore (letzteres nur mit Abstrichen) sind nette Alternativen wenn es auch etwas actionreicher sein darf. Allerdings haben beide im Bereich Story nicht sonderlich viel auf der Pfanne.
Besser gefällt mir da die Soulblazer Trilogie. Der erste Teil ist aus heutiger Sicht schon sehr speziell und vermutlich nur noch was für Fans. Der Nachfolger hingegen "Illusion of Time" ist da schon besser und speziell für Einsteiger in Sachen 16 Bit RPG's empfehlenswert. Leider etwas arg kitschig aber dafür spielt es sich sehr rund und kommt Zelda schon recht nahe. Das Finale "Terranigma" gilt allgemein als eines der besten 16 Bit Action Rollenspiele und das durchaus auch zurecht.
Handwerklich gut gemacht ist auch Lufia: Rise of the Sinistrals; welches zwar teilweise grausige Dialoge an Bord hat aber sonst eigentlich alles richtig macht. Hier muss man aber eine hohe Bereitschaft zu Rätseln mitbringen, denn die gibt es quasi in jedem Raum.
Ebenfalls sehr nett sind die beiden Breath of Fire Spiele; wobei hier der zweite Teil klar zu empfehlen ist - hat einige nette Ideen, eine gelungene Story und großen Umfang. Teil 1 ist etwas zu altbacken aber sehr charmant.
Super Mario RPG ist sicher nicht das komplexeste SNES RPG, dafür aber sicher eines der witzigsten und eingängigsten. Sollte man gespielt haben, wenn man die Möglichkeit hat.
Ein echter Geheimtipp ist Shadowrun, welches vom Setting her (Cyberpunk + Fanatsy) völlig andere Wege geht und mit einer extrem spannenden Story und Atmosphäre besticht - aber auch mit einem beinharten Schwierigkeitsgrad. Für Liebhaber.
Earthbound nenne ich jetzt nur der Vollständigkeit halber. Ich liebe es; aber die Anschaffungskosten sind halt wirklich enorm.
Ansonsten gibt es als US Versionen noch einige nette West-RPG's wie Might & Magic 3, Dungeon Master, Eye of the Beholder oder Wizzardry - aber die sind halt SEHR altmodisch und mehr Zahlenspielereien die man mit heutigen RPG's nicht mehr wirklich vergleichen kann. Muss man mögen.
Leider sind in Deutschland nur sehr wenige RPG's erschienen. Die meisten blieben in Japan, einige wenige kamen immerhin in die USA. Die meisten genannten Spiele sind ergo auch US-Versionen.
Edit: Hier noch mal kurz was zu Umsetzungen:
Final Fantasy Spiele sind auch für GBA umgesetzt worden. Ebenso die beiden Breath of Fire.
Chrono Trigger gab es für DS. Secret of Mana ist für Apple Geräte erschienen (bin da kein Experte, daher keine näheren Infos).
Der Rest ist bislang auf dem SNES geblieben.
Virtual Console Umsetzungen spare ich mir jetzt einfach mal - es soll da so eine wahnsinnig coole Website geben, die eine Datenbank für solche Fragen hat.